Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc173A0JLY1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms