Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RNP2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RNP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RNP2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms