Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,34■■■■■ 4,37
Setbp1Q9Z180 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,34■■■■■ 4,37
Setbp1Q9Z180 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42,29■■■■■ 4,36
Setbp1Q9Z180 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Setbp1Q9Z180 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42,28■■■■■ 4,36
Setbp1Q9Z180 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Setbp1Q9Z180 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
Setbp1Q9Z180 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,25■■■■■ 4,35
Setbp1Q9Z180 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42,24■■■■■ 4,35
Setbp1Q9Z180 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Setbp1Q9Z180 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42,2■■■■■ 4,35
Setbp1Q9Z180 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,19■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42,16■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42,15■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42,14■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42,13■■■■■ 4,34
Setbp1Q9Z180 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,13■■■■■ 4,33
Setbp1Q9Z180 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,12■■■■■ 4,33
Setbp1Q9Z180 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42,12■■■■■ 4,33
Setbp1Q9Z180 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Setbp1Q9Z180 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Setbp1Q9Z180 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,08■■■■■ 4,33
Setbp1Q9Z180 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
Setbp1Q9Z180 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4,31
Setbp1Q9Z180 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
Setbp1Q9Z180 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41,98■■■■■ 4,31
Setbp1Q9Z180 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41,97■■■■■ 4,31
Setbp1Q9Z180 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
Setbp1Q9Z180 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,95■■■■■ 4,31
Setbp1Q9Z180 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41,93■■■■■ 4,3
Setbp1Q9Z180 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41,91■■■■■ 4,3
Setbp1Q9Z180 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
Setbp1Q9Z180 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
Setbp1Q9Z180 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41,82■■■■■ 4,29
Setbp1Q9Z180 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,81■■■■■ 4,28
Setbp1Q9Z180 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
Setbp1Q9Z180 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41,76■■■■■ 4,28
Setbp1Q9Z180 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41,76■■■■■ 4,27
Setbp1Q9Z180 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41,71■■■■■ 4,27
Setbp1Q9Z180 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41,68■■■■■ 4,26
Setbp1Q9Z180 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41,66■■■■■ 4,26
Setbp1Q9Z180 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41,61■■■■■ 4,25
Setbp1Q9Z180 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Setbp1Q9Z180 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41,6■■■■■ 4,25
Setbp1Q9Z180 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
Setbp1Q9Z180 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41,57■■■■■ 4,25
Setbp1Q9Z180 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41,56■■■■■ 4,24
Setbp1Q9Z180 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Setbp1Q9Z180 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41,49■■■■■ 4,23
Setbp1Q9Z180 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41,48■■■■■ 4,23
Setbp1Q9Z180 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41,48■■■■■ 4,23
Setbp1Q9Z180 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Setbp1Q9Z180 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,46■■■■■ 4,23
Setbp1Q9Z180 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
Setbp1Q9Z180 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41,41■■■■■ 4,22
Setbp1Q9Z180 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41,41■■■■■ 4,22
Setbp1Q9Z180 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,22
Setbp1Q9Z180 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
Setbp1Q9Z180 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,2
Setbp1Q9Z180 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,25■■■■■ 4,19
Setbp1Q9Z180 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Setbp1Q9Z180 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Setbp1Q9Z180 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41,22■■■■■ 4,19
Setbp1Q9Z180 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Setbp1Q9Z180 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Setbp1Q9Z180 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,18■■■■■ 4,18
Setbp1Q9Z180 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Setbp1Q9Z180 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41,12■■■■■ 4,17
Setbp1Q9Z180 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41,1■■■■■ 4,17
Setbp1Q9Z180 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Setbp1Q9Z180 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Setbp1Q9Z180 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Setbp1Q9Z180 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Setbp1Q9Z180 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
Setbp1Q9Z180 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,98■■■■■ 4,15
Setbp1Q9Z180 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,94■■■■■ 4,14
Setbp1Q9Z180 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Setbp1Q9Z180 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Setbp1Q9Z180 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Setbp1Q9Z180 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Setbp1Q9Z180 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Setbp1Q9Z180 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Setbp1Q9Z180 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40,75■■■■■ 4,11
Setbp1Q9Z180 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Setbp1Q9Z180 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Setbp1Q9Z180 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Setbp1Q9Z180 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Setbp1Q9Z180 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms