Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnurfQ9WU12 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnurfQ9WU12 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnurfQ9WU12 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnurfQ9WU12 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnurfQ9WU12 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnurfQ9WU12 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnurfQ9WU12 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnurfQ9WU12 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms