Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Usp21Q9QZL6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Usp21Q9QZL6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Usp21Q9QZL6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Usp21Q9QZL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33,55■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Usp21Q9QZL6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Usp21Q9QZL6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Usp21Q9QZL6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Usp21Q9QZL6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Usp21Q9QZL6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Usp21Q9QZL6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Usp21Q9QZL6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Usp21Q9QZL6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Usp21Q9QZL6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Usp21Q9QZL6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Usp21Q9QZL6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Usp21Q9QZL6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Usp21Q9QZL6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Usp21Q9QZL6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Usp21Q9QZL6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Usp21Q9QZL6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Usp21Q9QZL6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Usp21Q9QZL6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Usp21Q9QZL6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Usp21Q9QZL6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Usp21Q9QZL6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Usp21Q9QZL6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Usp21Q9QZL6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Usp21Q9QZL6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Usp21Q9QZL6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Usp21Q9QZL6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Usp21Q9QZL6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
Usp21Q9QZL6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Usp21Q9QZL6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Usp21Q9QZL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Usp21Q9QZL6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Usp21Q9QZL6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Usp21Q9QZL6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Usp21Q9QZL6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Usp21Q9QZL6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Usp21Q9QZL6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Usp21Q9QZL6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Usp21Q9QZL6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Usp21Q9QZL6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,76■■■□□ 2,83
Usp21Q9QZL6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Usp21Q9QZL6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Usp21Q9QZL6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Usp21Q9QZL6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Usp21Q9QZL6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Usp21Q9QZL6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Usp21Q9QZL6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Usp21Q9QZL6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Usp21Q9QZL6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Usp21Q9QZL6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Usp21Q9QZL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Usp21Q9QZL6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Usp21Q9QZL6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Usp21Q9QZL6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Usp21Q9QZL6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Usp21Q9QZL6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Usp21Q9QZL6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Usp21Q9QZL6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Usp21Q9QZL6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Usp21Q9QZL6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Usp21Q9QZL6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Usp21Q9QZL6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Usp21Q9QZL6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Usp21Q9QZL6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Usp21Q9QZL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Usp21Q9QZL6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Usp21Q9QZL6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Usp21Q9QZL6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Usp21Q9QZL6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Usp21Q9QZL6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Usp21Q9QZL6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Usp21Q9QZL6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32,22■■■□□ 2,75
Usp21Q9QZL6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms