Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31,95■■■□□ 2,71
Bcl11aQ9QYE3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Bcl11aQ9QYE3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Bcl11aQ9QYE3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Bcl11aQ9QYE3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,87■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Bcl11aQ9QYE3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Bcl11aQ9QYE3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Bcl11aQ9QYE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Bcl11aQ9QYE3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Bcl11aQ9QYE3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,76■■■□□ 2,68
Bcl11aQ9QYE3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Bcl11aQ9QYE3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Bcl11aQ9QYE3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Bcl11aQ9QYE3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Bcl11aQ9QYE3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Bcl11aQ9QYE3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Bcl11aQ9QYE3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Bcl11aQ9QYE3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Bcl11aQ9QYE3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Bcl11aQ9QYE3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Bcl11aQ9QYE3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Bcl11aQ9QYE3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Bcl11aQ9QYE3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Bcl11aQ9QYE3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Bcl11aQ9QYE3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Bcl11aQ9QYE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,45■■■□□ 2,63
Bcl11aQ9QYE3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Bcl11aQ9QYE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Bcl11aQ9QYE3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Bcl11aQ9QYE3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Bcl11aQ9QYE3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Bcl11aQ9QYE3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Bcl11aQ9QYE3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Bcl11aQ9QYE3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Bcl11aQ9QYE3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Bcl11aQ9QYE3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,6
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Bcl11aQ9QYE3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Bcl11aQ9QYE3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Bcl11aQ9QYE3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Bcl11aQ9QYE3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Bcl11aQ9QYE3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,1 ms