Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SyncQ9EPM5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SyncQ9EPM5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SyncQ9EPM5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SyncQ9EPM5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SyncQ9EPM5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SyncQ9EPM5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SyncQ9EPM5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SyncQ9EPM5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SyncQ9EPM5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SyncQ9EPM5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SyncQ9EPM5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SyncQ9EPM5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SyncQ9EPM5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SyncQ9EPM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SyncQ9EPM5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SyncQ9EPM5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SyncQ9EPM5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SyncQ9EPM5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SyncQ9EPM5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SyncQ9EPM5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SyncQ9EPM5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SyncQ9EPM5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SyncQ9EPM5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SyncQ9EPM5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SyncQ9EPM5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SyncQ9EPM5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SyncQ9EPM5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SyncQ9EPM5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SyncQ9EPM5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SyncQ9EPM5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SyncQ9EPM5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SyncQ9EPM5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SyncQ9EPM5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SyncQ9EPM5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SyncQ9EPM5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SyncQ9EPM5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SyncQ9EPM5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SyncQ9EPM5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SyncQ9EPM5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SyncQ9EPM5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SyncQ9EPM5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SyncQ9EPM5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SyncQ9EPM5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SyncQ9EPM5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SyncQ9EPM5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SyncQ9EPM5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SyncQ9EPM5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SyncQ9EPM5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SyncQ9EPM5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms