Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gadd45gip1Q9CR59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gadd45gip1Q9CR59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gadd45gip1Q9CR59 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gadd45gip1Q9CR59 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gadd45gip1Q9CR59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gadd45gip1Q9CR59 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gadd45gip1Q9CR59 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gadd45gip1Q9CR59 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gadd45gip1Q9CR59 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gadd45gip1Q9CR59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gadd45gip1Q9CR59 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gadd45gip1Q9CR59 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gadd45gip1Q9CR59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gadd45gip1Q9CR59 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gadd45gip1Q9CR59 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gadd45gip1Q9CR59 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gadd45gip1Q9CR59 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gadd45gip1Q9CR59 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gadd45gip1Q9CR59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gadd45gip1Q9CR59 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gadd45gip1Q9CR59 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gadd45gip1Q9CR59 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gadd45gip1Q9CR59 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gadd45gip1Q9CR59 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gadd45gip1Q9CR59 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gadd45gip1Q9CR59 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gadd45gip1Q9CR59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gadd45gip1Q9CR59 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gadd45gip1Q9CR59 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gadd45gip1Q9CR59 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gadd45gip1Q9CR59 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gadd45gip1Q9CR59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gadd45gip1Q9CR59 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gadd45gip1Q9CR59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gadd45gip1Q9CR59 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gadd45gip1Q9CR59 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gadd45gip1Q9CR59 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gadd45gip1Q9CR59 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gadd45gip1Q9CR59 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gadd45gip1Q9CR59 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gadd45gip1Q9CR59 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gadd45gip1Q9CR59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gadd45gip1Q9CR59 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gadd45gip1Q9CR59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gadd45gip1Q9CR59 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gadd45gip1Q9CR59 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gadd45gip1Q9CR59 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms