Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC5

Cdc42ep3, Cdc42 effector protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42ep3Q9CQC5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42ep3Q9CQC5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc42ep3Q9CQC5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc42ep3Q9CQC5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc42ep3Q9CQC5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc42ep3Q9CQC5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep3Q9CQC5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep3Q9CQC5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc42ep3Q9CQC5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdc42ep3Q9CQC5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42ep3Q9CQC5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42ep3Q9CQC5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42ep3Q9CQC5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42ep3Q9CQC5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep3Q9CQC5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42ep3Q9CQC5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42ep3Q9CQC5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42ep3Q9CQC5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42ep3Q9CQC5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42ep3Q9CQC5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42ep3Q9CQC5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep3Q9CQC5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep3Q9CQC5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep3Q9CQC5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep3Q9CQC5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc42ep3Q9CQC5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc42ep3Q9CQC5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep3Q9CQC5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42ep3Q9CQC5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42ep3Q9CQC5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep3Q9CQC5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42ep3Q9CQC5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42ep3Q9CQC5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42ep3Q9CQC5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdc42ep3Q9CQC5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42ep3Q9CQC5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42ep3Q9CQC5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42ep3Q9CQC5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42ep3Q9CQC5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc42ep3Q9CQC5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc42ep3Q9CQC5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep3Q9CQC5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep3Q9CQC5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdc42ep3Q9CQC5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdc42ep3Q9CQC5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc42ep3Q9CQC5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc42ep3Q9CQC5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc42ep3Q9CQC5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdc42ep3Q9CQC5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdc42ep3Q9CQC5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc42ep3Q9CQC5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc42ep3Q9CQC5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc42ep3Q9CQC5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc42ep3Q9CQC5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc42ep3Q9CQC5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc42ep3Q9CQC5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep3Q9CQC5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep3Q9CQC5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep3Q9CQC5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep3Q9CQC5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep3Q9CQC5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep3Q9CQC5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep3Q9CQC5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms