Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Ubl4bQ9CQ84 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Ubl4bQ9CQ84 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Ubl4bQ9CQ84 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Ubl4bQ9CQ84 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Ubl4bQ9CQ84 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
Ubl4bQ9CQ84 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Ubl4bQ9CQ84 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Ubl4bQ9CQ84 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC46.85■■■■■ 5.09
Ubl4bQ9CQ84 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
Ubl4bQ9CQ84 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Ubl4bQ9CQ84 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Ubl4bQ9CQ84 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Ubl4bQ9CQ84 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
Ubl4bQ9CQ84 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Ubl4bQ9CQ84 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Ubl4bQ9CQ84 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Ubl4bQ9CQ84 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Ubl4bQ9CQ84 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.08
Ubl4bQ9CQ84 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Ubl4bQ9CQ84 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Ubl4bQ9CQ84 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Ubl4bQ9CQ84 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC46.72■■■■■ 5.07
Ubl4bQ9CQ84 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Ubl4bQ9CQ84 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Ubl4bQ9CQ84 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Ubl4bQ9CQ84 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Ubl4bQ9CQ84 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Ubl4bQ9CQ84 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Ubl4bQ9CQ84 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Ubl4bQ9CQ84 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
Ubl4bQ9CQ84 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Ubl4bQ9CQ84 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
Ubl4bQ9CQ84 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.02
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
Ubl4bQ9CQ84 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Ubl4bQ9CQ84 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
Ubl4bQ9CQ84 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
Ubl4bQ9CQ84 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Ubl4bQ9CQ84 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
Ubl4bQ9CQ84 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
Ubl4bQ9CQ84 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Ubl4bQ9CQ84 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
Ubl4bQ9CQ84 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Ubl4bQ9CQ84 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Ubl4bQ9CQ84 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Ubl4bQ9CQ84 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
Ubl4bQ9CQ84 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Ubl4bQ9CQ84 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Ubl4bQ9CQ84 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Ubl4bQ9CQ84 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Ubl4bQ9CQ84 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Ubl4bQ9CQ84 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
Ubl4bQ9CQ84 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Ubl4bQ9CQ84 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Ubl4bQ9CQ84 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Ubl4bQ9CQ84 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Ubl4bQ9CQ84 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Ubl4bQ9CQ84 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Ubl4bQ9CQ84 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Ubl4bQ9CQ84 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Ubl4bQ9CQ84 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
Ubl4bQ9CQ84 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Ubl4bQ9CQ84 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Ubl4bQ9CQ84 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Ubl4bQ9CQ84 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Ubl4bQ9CQ84 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Ubl4bQ9CQ84 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Ubl4bQ9CQ84 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Ubl4bQ9CQ84 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Ubl4bQ9CQ84 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Ubl4bQ9CQ84 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Ubl4bQ9CQ84 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
Ubl4bQ9CQ84 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Ubl4bQ9CQ84 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Ubl4bQ9CQ84 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Ubl4bQ9CQ84 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Ubl4bQ9CQ84 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Ubl4bQ9CQ84 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Ubl4bQ9CQ84 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Ubl4bQ9CQ84 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
Ubl4bQ9CQ84 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Ubl4bQ9CQ84 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Ubl4bQ9CQ84 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Ubl4bQ9CQ84 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms