Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkhd1l1Q80ZA4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkhd1l1Q80ZA4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkhd1l1Q80ZA4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkhd1l1Q80ZA4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkhd1l1Q80ZA4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkhd1l1Q80ZA4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkhd1l1Q80ZA4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkhd1l1Q80ZA4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkhd1l1Q80ZA4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkhd1l1Q80ZA4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkhd1l1Q80ZA4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkhd1l1Q80ZA4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkhd1l1Q80ZA4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkhd1l1Q80ZA4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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