Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnot1Q6ZQ08 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot1Q6ZQ08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot1Q6ZQ08 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot1Q6ZQ08 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot1Q6ZQ08 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot1Q6ZQ08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot1Q6ZQ08 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot1Q6ZQ08 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot1Q6ZQ08 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnot1Q6ZQ08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot1Q6ZQ08 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot1Q6ZQ08 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnot1Q6ZQ08 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot1Q6ZQ08 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot1Q6ZQ08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot1Q6ZQ08 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot1Q6ZQ08 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnot1Q6ZQ08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnot1Q6ZQ08 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot1Q6ZQ08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot1Q6ZQ08 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot1Q6ZQ08 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot1Q6ZQ08 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot1Q6ZQ08 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot1Q6ZQ08 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot1Q6ZQ08 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnot1Q6ZQ08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot1Q6ZQ08 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot1Q6ZQ08 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot1Q6ZQ08 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot1Q6ZQ08 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot1Q6ZQ08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot1Q6ZQ08 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot1Q6ZQ08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot1Q6ZQ08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot1Q6ZQ08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot1Q6ZQ08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot1Q6ZQ08 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot1Q6ZQ08 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot1Q6ZQ08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot1Q6ZQ08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot1Q6ZQ08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot1Q6ZQ08 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot1Q6ZQ08 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot1Q6ZQ08 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot1Q6ZQ08 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot1Q6ZQ08 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot1Q6ZQ08 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cnot1Q6ZQ08 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot1Q6ZQ08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot1Q6ZQ08 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnot1Q6ZQ08 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms