Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpeQ6RT24 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpeQ6RT24 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpeQ6RT24 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpeQ6RT24 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpeQ6RT24 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpeQ6RT24 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpeQ6RT24 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpeQ6RT24 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpeQ6RT24 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpeQ6RT24 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpeQ6RT24 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpeQ6RT24 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpeQ6RT24 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpeQ6RT24 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpeQ6RT24 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpeQ6RT24 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpeQ6RT24 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpeQ6RT24 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpeQ6RT24 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpeQ6RT24 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpeQ6RT24 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpeQ6RT24 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpeQ6RT24 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CenpeQ6RT24 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpeQ6RT24 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CenpeQ6RT24 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CenpeQ6RT24 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpeQ6RT24 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpeQ6RT24 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpeQ6RT24 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpeQ6RT24 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpeQ6RT24 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpeQ6RT24 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpeQ6RT24 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpeQ6RT24 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpeQ6RT24 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpeQ6RT24 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpeQ6RT24 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpeQ6RT24 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpeQ6RT24 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpeQ6RT24 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpeQ6RT24 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpeQ6RT24 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpeQ6RT24 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpeQ6RT24 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpeQ6RT24 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpeQ6RT24 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpeQ6RT24 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpeQ6RT24 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpeQ6RT24 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpeQ6RT24 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpeQ6RT24 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpeQ6RT24 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpeQ6RT24 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpeQ6RT24 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpeQ6RT24 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpeQ6RT24 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpeQ6RT24 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpeQ6RT24 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpeQ6RT24 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpeQ6RT24 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms