Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn3Q62471 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn3Q62471 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn3Q62471 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn3Q62471 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn3Q62471 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn3Q62471 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn3Q62471 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn3Q62471 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn3Q62471 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lcn3Q62471 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn3Q62471 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn3Q62471 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn3Q62471 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn3Q62471 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn3Q62471 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn3Q62471 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lcn3Q62471 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn3Q62471 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn3Q62471 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn3Q62471 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn3Q62471 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn3Q62471 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn3Q62471 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn3Q62471 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn3Q62471 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn3Q62471 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn3Q62471 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms