Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pik3c2aQ61194 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Pik3c2aQ61194 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Pik3c2aQ61194 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Pik3c2aQ61194 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Pik3c2aQ61194 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Pik3c2aQ61194 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Pik3c2aQ61194 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pik3c2aQ61194 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pik3c2aQ61194 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pik3c2aQ61194 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pik3c2aQ61194 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pik3c2aQ61194 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pik3c2aQ61194 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pik3c2aQ61194 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pik3c2aQ61194 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pik3c2aQ61194 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pik3c2aQ61194 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pik3c2aQ61194 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pik3c2aQ61194 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pik3c2aQ61194 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pik3c2aQ61194 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pik3c2aQ61194 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pik3c2aQ61194 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pik3c2aQ61194 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Pik3c2aQ61194 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pik3c2aQ61194 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pik3c2aQ61194 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pik3c2aQ61194 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Pik3c2aQ61194 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pik3c2aQ61194 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pik3c2aQ61194 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Pik3c2aQ61194 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pik3c2aQ61194 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pik3c2aQ61194 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pik3c2aQ61194 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pik3c2aQ61194 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Pik3c2aQ61194 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pik3c2aQ61194 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pik3c2aQ61194 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pik3c2aQ61194 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pik3c2aQ61194 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pik3c2aQ61194 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pik3c2aQ61194 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Pik3c2aQ61194 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pik3c2aQ61194 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pik3c2aQ61194 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Pik3c2aQ61194 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pik3c2aQ61194 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Pik3c2aQ61194 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pik3c2aQ61194 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pik3c2aQ61194 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pik3c2aQ61194 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pik3c2aQ61194 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pik3c2aQ61194 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pik3c2aQ61194 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pik3c2aQ61194 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pik3c2aQ61194 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Pik3c2aQ61194 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pik3c2aQ61194 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Pik3c2aQ61194 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pik3c2aQ61194 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Pik3c2aQ61194 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pik3c2aQ61194 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Pik3c2aQ61194 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pik3c2aQ61194 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pik3c2aQ61194 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pik3c2aQ61194 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pik3c2aQ61194 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pik3c2aQ61194 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pik3c2aQ61194 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pik3c2aQ61194 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Pik3c2aQ61194 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pik3c2aQ61194 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pik3c2aQ61194 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pik3c2aQ61194 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pik3c2aQ61194 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pik3c2aQ61194 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pik3c2aQ61194 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pik3c2aQ61194 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pik3c2aQ61194 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Pik3c2aQ61194 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pik3c2aQ61194 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pik3c2aQ61194 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms