Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Psme4Q5SSW2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Psme4Q5SSW2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Psme4Q5SSW2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Psme4Q5SSW2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Psme4Q5SSW2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Psme4Q5SSW2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Psme4Q5SSW2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Psme4Q5SSW2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Psme4Q5SSW2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Psme4Q5SSW2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Psme4Q5SSW2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Psme4Q5SSW2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Psme4Q5SSW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Psme4Q5SSW2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Psme4Q5SSW2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Psme4Q5SSW2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Psme4Q5SSW2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Psme4Q5SSW2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Psme4Q5SSW2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Psme4Q5SSW2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psme4Q5SSW2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psme4Q5SSW2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Psme4Q5SSW2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Psme4Q5SSW2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Psme4Q5SSW2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Psme4Q5SSW2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Psme4Q5SSW2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Psme4Q5SSW2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Psme4Q5SSW2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Psme4Q5SSW2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Psme4Q5SSW2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Psme4Q5SSW2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Psme4Q5SSW2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Psme4Q5SSW2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Psme4Q5SSW2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Psme4Q5SSW2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Psme4Q5SSW2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Psme4Q5SSW2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Psme4Q5SSW2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Psme4Q5SSW2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Psme4Q5SSW2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Psme4Q5SSW2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Psme4Q5SSW2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Psme4Q5SSW2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Psme4Q5SSW2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Psme4Q5SSW2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Psme4Q5SSW2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Psme4Q5SSW2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Psme4Q5SSW2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Psme4Q5SSW2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Psme4Q5SSW2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Psme4Q5SSW2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Psme4Q5SSW2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Psme4Q5SSW2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Psme4Q5SSW2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms