Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tnrc6cQ3UHC0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tnrc6cQ3UHC0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Tnrc6cQ3UHC0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Tnrc6cQ3UHC0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Tnrc6cQ3UHC0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Tnrc6cQ3UHC0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Tnrc6cQ3UHC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Tnrc6cQ3UHC0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Tnrc6cQ3UHC0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Tnrc6cQ3UHC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Tnrc6cQ3UHC0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tnrc6cQ3UHC0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tnrc6cQ3UHC0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Tnrc6cQ3UHC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tnrc6cQ3UHC0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tnrc6cQ3UHC0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tnrc6cQ3UHC0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tnrc6cQ3UHC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Tnrc6cQ3UHC0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tnrc6cQ3UHC0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tnrc6cQ3UHC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Tnrc6cQ3UHC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tnrc6cQ3UHC0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Tnrc6cQ3UHC0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tnrc6cQ3UHC0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Tnrc6cQ3UHC0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tnrc6cQ3UHC0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Tnrc6cQ3UHC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Tnrc6cQ3UHC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Tnrc6cQ3UHC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tnrc6cQ3UHC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tnrc6cQ3UHC0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tnrc6cQ3UHC0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Tnrc6cQ3UHC0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tnrc6cQ3UHC0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Tnrc6cQ3UHC0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tnrc6cQ3UHC0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tnrc6cQ3UHC0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Tnrc6cQ3UHC0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tnrc6cQ3UHC0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Tnrc6cQ3UHC0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tnrc6cQ3UHC0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tnrc6cQ3UHC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Tnrc6cQ3UHC0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Tnrc6cQ3UHC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Tnrc6cQ3UHC0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Tnrc6cQ3UHC0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Tnrc6cQ3UHC0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tnrc6cQ3UHC0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tnrc6cQ3UHC0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tnrc6cQ3UHC0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tnrc6cQ3UHC0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tnrc6cQ3UHC0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Tnrc6cQ3UHC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tnrc6cQ3UHC0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Tnrc6cQ3UHC0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tnrc6cQ3UHC0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tnrc6cQ3UHC0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tnrc6cQ3UHC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tnrc6cQ3UHC0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tnrc6cQ3UHC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tnrc6cQ3UHC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Tnrc6cQ3UHC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tnrc6cQ3UHC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tnrc6cQ3UHC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tnrc6cQ3UHC0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms