Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUA9

Pomk, Protein O-mannose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomkQ3TUA9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
PomkQ3TUA9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
PomkQ3TUA9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
PomkQ3TUA9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
PomkQ3TUA9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
PomkQ3TUA9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
PomkQ3TUA9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
PomkQ3TUA9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
PomkQ3TUA9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
PomkQ3TUA9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
PomkQ3TUA9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
PomkQ3TUA9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
PomkQ3TUA9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
PomkQ3TUA9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
PomkQ3TUA9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,3■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
PomkQ3TUA9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
PomkQ3TUA9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
PomkQ3TUA9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
PomkQ3TUA9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
PomkQ3TUA9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29,21■■■□□ 2,27
PomkQ3TUA9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
PomkQ3TUA9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
PomkQ3TUA9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
PomkQ3TUA9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
PomkQ3TUA9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
PomkQ3TUA9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
PomkQ3TUA9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,08■■■□□ 2,25
PomkQ3TUA9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
PomkQ3TUA9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
PomkQ3TUA9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
PomkQ3TUA9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,02■■■□□ 2,24
PomkQ3TUA9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
PomkQ3TUA9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
PomkQ3TUA9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
PomkQ3TUA9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
PomkQ3TUA9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,98■■■□□ 2,23
PomkQ3TUA9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
PomkQ3TUA9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
PomkQ3TUA9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
PomkQ3TUA9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
PomkQ3TUA9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
PomkQ3TUA9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
PomkQ3TUA9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,89■■■□□ 2,22
PomkQ3TUA9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
PomkQ3TUA9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
PomkQ3TUA9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
PomkQ3TUA9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,81■■■□□ 2,2
PomkQ3TUA9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
PomkQ3TUA9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
PomkQ3TUA9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
PomkQ3TUA9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
PomkQ3TUA9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
PomkQ3TUA9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
PomkQ3TUA9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
PomkQ3TUA9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
PomkQ3TUA9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
PomkQ3TUA9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
PomkQ3TUA9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
PomkQ3TUA9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
PomkQ3TUA9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
PomkQ3TUA9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
PomkQ3TUA9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
PomkQ3TUA9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
PomkQ3TUA9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
PomkQ3TUA9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
PomkQ3TUA9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
PomkQ3TUA9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
PomkQ3TUA9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
PomkQ3TUA9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
PomkQ3TUA9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
PomkQ3TUA9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
PomkQ3TUA9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
PomkQ3TUA9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
PomkQ3TUA9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
PomkQ3TUA9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
PomkQ3TUA9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
PomkQ3TUA9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
PomkQ3TUA9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
PomkQ3TUA9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
PomkQ3TUA9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
PomkQ3TUA9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
PomkQ3TUA9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
PomkQ3TUA9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
PomkQ3TUA9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
PomkQ3TUA9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
PomkQ3TUA9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
PomkQ3TUA9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
PomkQ3TUA9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
PomkQ3TUA9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms