Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CluQ06890 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluQ06890 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluQ06890 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CluQ06890 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CluQ06890 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CluQ06890 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CluQ06890 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CluQ06890 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CluQ06890 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CluQ06890 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CluQ06890 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CluQ06890 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CluQ06890 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CluQ06890 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CluQ06890 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CluQ06890 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CluQ06890 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CluQ06890 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CluQ06890 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CluQ06890 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CluQ06890 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CluQ06890 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CluQ06890 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CluQ06890 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CluQ06890 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CluQ06890 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CluQ06890 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CluQ06890 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CluQ06890 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CluQ06890 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CluQ06890 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CluQ06890 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CluQ06890 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CluQ06890 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CluQ06890 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CluQ06890 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CluQ06890 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CluQ06890 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CluQ06890 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CluQ06890 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CluQ06890 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CluQ06890 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CluQ06890 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CluQ06890 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CluQ06890 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CluQ06890 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CluQ06890 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CluQ06890 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CluQ06890 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CluQ06890 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CluQ06890 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CluQ06890 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CluQ06890 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CluQ06890 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CluQ06890 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CluQ06890 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CluQ06890 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CluQ06890 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CluQ06890 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CluQ06890 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluQ06890 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluQ06890 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluQ06890 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CluQ06890 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluQ06890 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CluQ06890 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluQ06890 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CluQ06890 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluQ06890 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluQ06890 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluQ06890 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CluQ06890 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CluQ06890 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluQ06890 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CluQ06890 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CluQ06890 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CluQ06890 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CluQ06890 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CluQ06890 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CluQ06890 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CluQ06890 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CluQ06890 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CluQ06890 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CluQ06890 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CluQ06890 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CluQ06890 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CluQ06890 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CluQ06890 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CluQ06890 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CluQ06890 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CluQ06890 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CluQ06890 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CluQ06890 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CluQ06890 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CluQ06890 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CluQ06890 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CluQ06890 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CluQ06890 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CluQ06890 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms