Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Nhlh1Q02576 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Nhlh1Q02576 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Nhlh1Q02576 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Nhlh1Q02576 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Nhlh1Q02576 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Nhlh1Q02576 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Nhlh1Q02576 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Nhlh1Q02576 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Nhlh1Q02576 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Nhlh1Q02576 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Nhlh1Q02576 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Nhlh1Q02576 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Nhlh1Q02576 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Nhlh1Q02576 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Nhlh1Q02576 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Nhlh1Q02576 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Nhlh1Q02576 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Nhlh1Q02576 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Nhlh1Q02576 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Nhlh1Q02576 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Nhlh1Q02576 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Nhlh1Q02576 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Nhlh1Q02576 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Nhlh1Q02576 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Nhlh1Q02576 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Nhlh1Q02576 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Nhlh1Q02576 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Nhlh1Q02576 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Nhlh1Q02576 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Nhlh1Q02576 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Nhlh1Q02576 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Nhlh1Q02576 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Nhlh1Q02576 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Nhlh1Q02576 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Nhlh1Q02576 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Nhlh1Q02576 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Nhlh1Q02576 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Nhlh1Q02576 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Nhlh1Q02576 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Nhlh1Q02576 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Nhlh1Q02576 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Nhlh1Q02576 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Nhlh1Q02576 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Nhlh1Q02576 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Nhlh1Q02576 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Nhlh1Q02576 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Nhlh1Q02576 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Nhlh1Q02576 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Nhlh1Q02576 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Nhlh1Q02576 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Nhlh1Q02576 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Nhlh1Q02576 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Nhlh1Q02576 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Nhlh1Q02576 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Nhlh1Q02576 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Nhlh1Q02576 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Nhlh1Q02576 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Nhlh1Q02576 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Nhlh1Q02576 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Nhlh1Q02576 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Nhlh1Q02576 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Nhlh1Q02576 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Nhlh1Q02576 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Nhlh1Q02576 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Nhlh1Q02576 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Nhlh1Q02576 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Nhlh1Q02576 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Nhlh1Q02576 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Nhlh1Q02576 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Nhlh1Q02576 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Nhlh1Q02576 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Nhlh1Q02576 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Nhlh1Q02576 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Nhlh1Q02576 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms