Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Apba2P98084 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Apba2P98084 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Apba2P98084 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Apba2P98084 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Apba2P98084 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Apba2P98084 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Apba2P98084 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Apba2P98084 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Apba2P98084 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Apba2P98084 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Apba2P98084 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Apba2P98084 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Apba2P98084 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Apba2P98084 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Apba2P98084 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Apba2P98084 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Apba2P98084 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Apba2P98084 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Apba2P98084 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Apba2P98084 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Apba2P98084 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Apba2P98084 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Apba2P98084 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Apba2P98084 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Apba2P98084 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Apba2P98084 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Apba2P98084 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Apba2P98084 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Apba2P98084 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Apba2P98084 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Apba2P98084 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Apba2P98084 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Apba2P98084 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Apba2P98084 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Apba2P98084 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Apba2P98084 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Apba2P98084 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Apba2P98084 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Apba2P98084 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms