Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18527 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18527 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18527 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P18527 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P18527 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18527 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18527 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P18527 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P18527 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18527 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18527 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P18527 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18527 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18527 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18527 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18527 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18527 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18527 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18527 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18527 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18527 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18527 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18527 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18527 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18527 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P18527 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18527 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18527 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18527 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18527 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18527 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18527 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18527 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18527 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18527 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P18527 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18527 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18527 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18527 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18527 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18527 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18527 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18527 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18527 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18527 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18527 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P18527 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P18527 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P18527 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P18527 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18527 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18527 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18527 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18527 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18527 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18527 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18527 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P18527 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P18527 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P18527 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P18527 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P18527 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P18527 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P18527 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P18527 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P18527 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P18527 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P18527 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P18527 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P18527 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P18527 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18527 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18527 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18527 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P18527 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18527 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18527 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18527 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P18527 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P18527 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18527 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P18527 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms