Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptan1P16546 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptan1P16546 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sptan1P16546 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptan1P16546 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptan1P16546 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptan1P16546 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptan1P16546 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptan1P16546 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptan1P16546 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptan1P16546 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptan1P16546 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptan1P16546 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptan1P16546 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptan1P16546 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptan1P16546 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptan1P16546 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptan1P16546 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptan1P16546 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptan1P16546 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptan1P16546 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptan1P16546 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptan1P16546 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptan1P16546 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptan1P16546 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptan1P16546 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptan1P16546 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptan1P16546 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptan1P16546 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptan1P16546 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptan1P16546 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptan1P16546 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptan1P16546 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptan1P16546 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptan1P16546 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptan1P16546 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptan1P16546 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptan1P16546 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptan1P16546 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptan1P16546 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptan1P16546 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptan1P16546 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptan1P16546 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptan1P16546 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptan1P16546 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptan1P16546 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptan1P16546 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptan1P16546 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sptan1P16546 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptan1P16546 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptan1P16546 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptan1P16546 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptan1P16546 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptan1P16546 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptan1P16546 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms