Protein–RNA interactions for Protein: P16043

Ghrh, Somatoliberin, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrhP16043 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GhrhP16043 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GhrhP16043 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GhrhP16043 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GhrhP16043 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GhrhP16043 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GhrhP16043 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GhrhP16043 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GhrhP16043 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GhrhP16043 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GhrhP16043 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GhrhP16043 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GhrhP16043 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GhrhP16043 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GhrhP16043 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GhrhP16043 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GhrhP16043 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GhrhP16043 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GhrhP16043 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GhrhP16043 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms