Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Polr1aO35134 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,42■■■■■ 4,38
Polr1aO35134 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,42■■■■■ 4,38
Polr1aO35134 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42,41■■■■■ 4,38
Polr1aO35134 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Polr1aO35134 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42,39■■■■■ 4,38
Polr1aO35134 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,37
Polr1aO35134 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Polr1aO35134 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42,35■■■■■ 4,37
Polr1aO35134 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42,34■■■■■ 4,37
Polr1aO35134 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,33■■■■■ 4,37
Polr1aO35134 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
Polr1aO35134 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42,27■■■■■ 4,36
Polr1aO35134 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
Polr1aO35134 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,22■■■■■ 4,35
Polr1aO35134 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Polr1aO35134 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,2■■■■■ 4,35
Polr1aO35134 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,19■■■■■ 4,34
Polr1aO35134 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
Polr1aO35134 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Polr1aO35134 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42,16■■■■■ 4,34
Polr1aO35134 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Polr1aO35134 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,32
Polr1aO35134 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42,06■■■■■ 4,32
Polr1aO35134 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,04■■■■■ 4,32
Polr1aO35134 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42,03■■■■■ 4,32
Polr1aO35134 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
Polr1aO35134 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
Polr1aO35134 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,98■■■■■ 4,31
Polr1aO35134 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,98■■■■■ 4,31
Polr1aO35134 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41,97■■■■■ 4,31
Polr1aO35134 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC41,95■■■■■ 4,31
Polr1aO35134 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
Polr1aO35134 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
Polr1aO35134 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
Polr1aO35134 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,3
Polr1aO35134 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
Polr1aO35134 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41,83■■■■■ 4,29
Polr1aO35134 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,82■■■■■ 4,29
Polr1aO35134 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41,81■■■■■ 4,28
Polr1aO35134 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
Polr1aO35134 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41,79■■■■■ 4,28
Polr1aO35134 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41,78■■■■■ 4,28
Polr1aO35134 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Polr1aO35134 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
Polr1aO35134 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
Polr1aO35134 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,75■■■■■ 4,27
Polr1aO35134 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Polr1aO35134 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41,67■■■■■ 4,26
Polr1aO35134 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,64■■■■■ 4,26
Polr1aO35134 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41,64■■■■■ 4,26
Polr1aO35134 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41,63■■■■■ 4,25
Polr1aO35134 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,62■■■■■ 4,25
Polr1aO35134 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Polr1aO35134 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Polr1aO35134 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41,6■■■■■ 4,25
Polr1aO35134 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Polr1aO35134 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Polr1aO35134 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41,54■■■■■ 4,24
Polr1aO35134 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,53■■■■■ 4,24
Polr1aO35134 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Polr1aO35134 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,52■■■■■ 4,24
Polr1aO35134 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,5■■■■■ 4,23
Polr1aO35134 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Polr1aO35134 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Polr1aO35134 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Polr1aO35134 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Polr1aO35134 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Polr1aO35134 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Polr1aO35134 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41,44■■■■■ 4,22
Polr1aO35134 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,43■■■■■ 4,22
Polr1aO35134 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Polr1aO35134 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41,4■■■■■ 4,22
Polr1aO35134 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Polr1aO35134 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Polr1aO35134 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,22
Polr1aO35134 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,36■■■■■ 4,21
Polr1aO35134 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,35■■■■■ 4,21
Polr1aO35134 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41,34■■■■■ 4,21
Polr1aO35134 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Polr1aO35134 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41,32■■■■■ 4,2
Polr1aO35134 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
Polr1aO35134 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Polr1aO35134 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Polr1aO35134 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41,27■■■■■ 4,2
Polr1aO35134 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41,24■■■■■ 4,19
Polr1aO35134 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41,24■■■■■ 4,19
Polr1aO35134 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Polr1aO35134 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Polr1aO35134 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Polr1aO35134 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41,21■■■■■ 4,19
Polr1aO35134 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,18■■■■■ 4,18
Polr1aO35134 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Polr1aO35134 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Polr1aO35134 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Polr1aO35134 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Polr1aO35134 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Polr1aO35134 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41,09■■■■■ 4,17
Polr1aO35134 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41,08■■■■■ 4,17
Polr1aO35134 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms