Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3hdm1E9Q9Q2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3hdm1E9Q9Q2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
R3hdm1E9Q9Q2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
R3hdm1E9Q9Q2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3hdm1E9Q9Q2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
R3hdm1E9Q9Q2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
R3hdm1E9Q9Q2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
R3hdm1E9Q9Q2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3hdm1E9Q9Q2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3hdm1E9Q9Q2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3hdm1E9Q9Q2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3hdm1E9Q9Q2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
R3hdm1E9Q9Q2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3hdm1E9Q9Q2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3hdm1E9Q9Q2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3hdm1E9Q9Q2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3hdm1E9Q9Q2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3hdm1E9Q9Q2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
R3hdm1E9Q9Q2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3hdm1E9Q9Q2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3hdm1E9Q9Q2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3hdm1E9Q9Q2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
R3hdm1E9Q9Q2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
R3hdm1E9Q9Q2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
R3hdm1E9Q9Q2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3hdm1E9Q9Q2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3hdm1E9Q9Q2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3hdm1E9Q9Q2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3hdm1E9Q9Q2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3hdm1E9Q9Q2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3hdm1E9Q9Q2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3hdm1E9Q9Q2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3hdm1E9Q9Q2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3hdm1E9Q9Q2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3hdm1E9Q9Q2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
R3hdm1E9Q9Q2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
R3hdm1E9Q9Q2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
R3hdm1E9Q9Q2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
R3hdm1E9Q9Q2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
R3hdm1E9Q9Q2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3hdm1E9Q9Q2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3hdm1E9Q9Q2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
R3hdm1E9Q9Q2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3hdm1E9Q9Q2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3hdm1E9Q9Q2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3hdm1E9Q9Q2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3hdm1E9Q9Q2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3hdm1E9Q9Q2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3hdm1E9Q9Q2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
R3hdm1E9Q9Q2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3hdm1E9Q9Q2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
R3hdm1E9Q9Q2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms