Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd2E9Q1M1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd2E9Q1M1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd2E9Q1M1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd2E9Q1M1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd2E9Q1M1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd2E9Q1M1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd2E9Q1M1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd2E9Q1M1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd2E9Q1M1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd2E9Q1M1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd2E9Q1M1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd2E9Q1M1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd2E9Q1M1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd2E9Q1M1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd2E9Q1M1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd2E9Q1M1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd2E9Q1M1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd2E9Q1M1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd2E9Q1M1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd2E9Q1M1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd2E9Q1M1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd2E9Q1M1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd2E9Q1M1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd2E9Q1M1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd2E9Q1M1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd2E9Q1M1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd2E9Q1M1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd2E9Q1M1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd2E9Q1M1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdzd2E9Q1M1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd2E9Q1M1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd2E9Q1M1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd2E9Q1M1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd2E9Q1M1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd2E9Q1M1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd2E9Q1M1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd2E9Q1M1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd2E9Q1M1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd2E9Q1M1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd2E9Q1M1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzd2E9Q1M1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms