Protein–RNA interactions for Protein: B2RXB2

Hsbp1l1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsbp1l1B2RXB2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsbp1l1B2RXB2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hsbp1l1B2RXB2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hsbp1l1B2RXB2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsbp1l1B2RXB2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsbp1l1B2RXB2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsbp1l1B2RXB2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsbp1l1B2RXB2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsbp1l1B2RXB2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hsbp1l1B2RXB2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hsbp1l1B2RXB2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsbp1l1B2RXB2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hsbp1l1B2RXB2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hsbp1l1B2RXB2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsbp1l1B2RXB2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsbp1l1B2RXB2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hsbp1l1B2RXB2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hsbp1l1B2RXB2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms