Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem238A9JSM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem238A9JSM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem238A9JSM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem238A9JSM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem238A9JSM3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem238A9JSM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem238A9JSM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem238A9JSM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem238A9JSM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem238A9JSM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem238A9JSM3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem238A9JSM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem238A9JSM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms