Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd7A2AJK6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd7A2AJK6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd7A2AJK6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd7A2AJK6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd7A2AJK6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd7A2AJK6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd7A2AJK6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd7A2AJK6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd7A2AJK6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chd7A2AJK6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd7A2AJK6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd7A2AJK6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd7A2AJK6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd7A2AJK6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd7A2AJK6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd7A2AJK6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd7A2AJK6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd7A2AJK6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd7A2AJK6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd7A2AJK6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd7A2AJK6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd7A2AJK6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd7A2AJK6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd7A2AJK6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd7A2AJK6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd7A2AJK6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd7A2AJK6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd7A2AJK6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd7A2AJK6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd7A2AJK6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd7A2AJK6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd7A2AJK6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd7A2AJK6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd7A2AJK6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd7A2AJK6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd7A2AJK6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd7A2AJK6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd7A2AJK6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd7A2AJK6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd7A2AJK6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd7A2AJK6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd7A2AJK6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd7A2AJK6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd7A2AJK6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd7A2AJK6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd7A2AJK6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd7A2AJK6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd7A2AJK6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd7A2AJK6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd7A2AJK6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd7A2AJK6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd7A2AJK6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms