Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gpc1Q9QZF2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gpc1Q9QZF2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.5 ms