Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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