Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm14323-201ENSMUST00000122418 627 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm45780-201ENSMUST00000212089 224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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