Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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