Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc187Q8C5V8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc187Q8C5V8 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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