Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm45780-201ENSMUST00000212089 224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm16350-201ENSMUST00000162958 446 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm14323-201ENSMUST00000122418 627 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms