Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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