Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Otud5Q3U2S4 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Otud5Q3U2S4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Otud5Q3U2S4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Otud5Q3U2S4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Otud5Q3U2S4 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Otud5Q3U2S4 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Otud5Q3U2S4 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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