Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms