Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms