Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp2b3Q0VF55 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms