Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms