Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms