Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms