Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.2 ms