Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxd13P70217 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxd13P70217 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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