Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms