Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa8P50706 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa8P50706 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms