Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NapbP28663 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NapbP28663 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NapbP28663 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NapbP28663 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms