Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TtrP07309 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TtrP07309 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms